中国共产主义青年团是中国共产党领导的先进青年的群众组织,作为党的助手和后备军，担负着团结和教育广大青年学生，执行党的青年工作方针，创造性地开展工作的职能。医学系团总支于2004年3月成立，是在医学系党支部和院团委的领导下开展工作，坚持“党有号召，团有行动”的优良传统，以引导，鼓励和支持青年正确前进为己任。其下设：
书记处：（办公室）各类会议的记录，协调各部开展工作
宣传部：负责宣传工作
组织部：负责团员及团籍管理，团费收缴，组织评优工作
实践部：负责社会实践
文娱部：负责文娱活动
我系团总支自成立以来，积极响应学院团委的号召，形成了"系部团总支、班级团支部"两级团组织运行机制，使我系团的工作在新的形势下顺利适应，团组织的协调能力得到进一步加强，综合实力和整体优势得以初步体现。（成绩 ：在各级领导的正确领导和大力支持下，各级团干部的积极努力下，广大团员青年的热心参与与支持下）
我们始终牢记党的领导，团的宗旨，矢志奋斗，开拓创新，与时俱进，以更加饱满的热情投入到广大师生的服务中，谱写出更加完美的青年之歌。
广大青年朋友，“青年兴则国家兴，青年强则国家强。”你们是祖国的未来，民族的希望，在任何时期，你们都是富有朝气最富有创造，最富有生命力的群体。把握这次机遇，展开拼搏的翅膀，开启智慧的源泉，创造辉煌的明天……

医学系团总支宣